由于端午节假日期间正逢夏收季节，因此小长假期间会出现大量的中短途民工客流和小部分中短途学生客流。同时，因天气逐渐转热及假期时间较短的原因，旅游线路将集中在中短途游，旅客出行方向将主要集中在上海、南京、淮安、扬州、盐城和苏锡常地区。根据客流调查，6月6日至9日，汽车南站日均客流量将达到11000人次左右，较平时增加约40%。预计小长假期间将形成两次客流高峰，分别为6月6日和6月9日，为此，汽车南站将在苏锡常和上海等线路的班线上安排加班车，以疏导客流。